Le Conseil départemental assure depuis 1992, grâce à son Service d’Assistance au Traitement des Effluents et au Suivi des Eaux (SATESE), le suivi de la qualité des cours d’eau avec la mise en place du Réseau Complémentaire Départemental (RCD). Ce réseau fait l’objet d’un partenariat entre plusieurs acteurs : l’Agence de l’eau Adour-Garonne, le Conseil Départemental et Public-Labos (site de Tarn et Garonne). Il vient ainsi compléter les réseaux de contrôle et de surveillance de portée nationale, en s’attachant aux cours d’eaux d’enjeux plus locaux. Au total, le département dispose d'une centaine de points d'observations répartis sur plus de 60 cours d’eau.

Le Réseau Complémentaire Départemental

Sur le réseau départemental, le SATESE assure pour une trentaine de stations de mesure :

• la réalisation des prélèvements, les mesures terrains (température, pH, conductivité, oxygène dissous…) et le transport d’échantillons jusqu’aux laboratoires agréées, selon des protocoles normalisés, au rythme de 6 fois  par an,
• l’évaluation du débit des cours d’eau par des relevés d’échelles limnimétriques et des campagnes de jaugeages de leur débit,
• la collecte et le stockage des mesures et résultats d’analyses dans une base de données.

Les qualités sont évaluées annuellement, en collaboration avec l’Agence de l’eau, pour l’ensemble des stations de prélèvement, selon une méthodologie reconnue nationalement. Il en résulte une classification de la qualité suivant un thermomètre à 5 degrés allant de la qualité très bonne à très mauvaise. L’ensemble de ces données constitue un historique par cours d’eau, consultable sur le site Système d’Information sur l’Eau (SIE) du Bassin Adour Garonne.